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分子生物学方法在浮游病毒多样性研究中的应用

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文档简介:

·技术与方法·生物技术通报BIOTECHNOLOGYBULLETIN2014年第2期自20世纪80年代以来,研究人员发现病毒广泛存在于海洋及淡水环境中,构成水生微生物群落的重要组成部分[1,2],其丰度高于细菌1-2个数量级别,每升水中的数量高达109个病毒粒子[3]。科学家曾推测,如果将海洋中庞大数量的病毒头尾相连排成一列,则这个队列的长度将比地球附近的60个星系相互间的距离总和还要长[4]。这一惊人发现使得人们对病毒在水环境中的生态学意义有了重新认识,同时也激发了人们对病毒生态学功能的研究兴趣。甚至有科学家认为这一重大发现如果提早若干年,很有可能影响海洋地理及湖沼现代生物学的收稿日期:2013-09-16基金项目:国家自然科学基金项目(31200019),江苏大学高级专业人才启动基金(11JDG151),中国博士后科学基金(20110491363)作者简介:高恶斌,男,博士,研究方向:微生物分子生态学;E-mail:gaofei7908@126.com分子生物学方法在浮游病毒多样性研究中的应用高恶斌王子乾(江苏大学环境与安全工程学院,镇江212013)摘要:病毒是海洋及淡水微生物群落的重要组成部分,在调控微生物环路、驱动生物地球化学循环、维持浮游植物与细菌多样性等方面扮演着重要角色。然而,传统的病毒培养及定量技术难以对浮游病毒群落结构与多样性进行深入而全面的解析。微生物分子生态学技术的快速发展及广泛应用为此提供了新的途径。概述了克隆文库分析方法、凝胶脉冲场电泳(PFGE)技术、DNA指纹图谱、DNA微阵列、宏基因组技术等分子生物学方法的基本概念及其在研究浮游病毒的种群结构与遗传多样性及其与环境因素之间的相互关系等方面的应用状况。关键词:分子生物学方法浮游病毒群落结构遗传多样性ApplicationofMolecularBiologicalMethodstoResearchontheGeneticDiversitiesofVirioplanktonGaoEbinWangZiqian(SchooloftheEnvironmentandSafetyEngineering,JiangsuUniversity,Zhenjiang212013)Abstract:Virusesarerecognizedasanimportantcomponentofaquaticmicro

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