利用PCR-DGGE 溯源典型农村塘坝饮用水中的污染

书第３１卷第３期２０１１年３月环境科学学报ＡｃｔａＳｃｉｅｎｔｉａｅＣｉｒｃｕｍｓｔａｎｔｉａｅＶｏｌ．３１，Ｎｏ．３Ｍａｒ．，２０１１基金项目：国家科技重大专项“水体污染控制与治理”资助项目（Ｎｏ．２００８ＺＸ０７４２５００２）ＳｕｐｐｏｒｔｅｄｂｙｔｈｅＮａｔｉｏｎａｌＦｕｎｄｅｄＭａｊｏｒＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙＰｒｏｊｅｃｔｏｆ“ＷａｔｅｒＰｏｌｌｕｔｉｏｎＣｏｎｔｒｏｌａｎｄＭａｎａｇｅｍｅｎｔ”（Ｎｏ．２００８ＺＸ０７４２５００２）作者简介：冯广达（１９８３—），男，Ｅｍａｉｌ：ｆｇｄ２００９＠ｌｉｖｅ．ｃｎ；通讯作者（责任作者），Ｅｍａｉｌ：ｚｈｕｈｏｎｇｈｕｉ６６＠ｙａｈｏｏ．ｃｏｍ．ｃｎＢｉｏｇｒａｐｈｙ：ＦＥＮＧＧｕａｎｇｄａ（１９８３—），ｍａｌｅ，Ｅｍａｉｌ：ｆｇｄ２００９＠ｌｉｖｅ．ｃｎ；Ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇａｕｔｈｏｒ，Ｅｍａｉｌ：ｚｈｕｈｏｎｇｈｕｉ６６＠ｙａｈｏｏ．ｃｏｍ．ｃｎ冯广达，邓名荣，郭俊，等．２０１１．利用ＰＣＲＤＧＧＥ溯源典型农村塘坝饮用水中的污染［Ｊ］．环境科学学报，３１（３）：４６８４７５ＦｅｎｇＧＤ，ＤｅｎｇＭＲ，ＧｕｏＪ，ｅｔａｌ．２０１１．ＭｉｃｒｏｂｉａｌｓｏｕｒｃｅｔｒａｃｋｉｎｇｏｆｐｏｌｌｕｔｉｏｎｉｎｔｙｐｉｃａｌｒｕｒａｌｐｏｎｄｄｒｉｎｋｉｎｇｗａｔｅｒｕｓｉｎｇＰＣＲＤＧＧＥ［Ｊ］．ＡｃｔａＳｃｉｅｎｔｉａｅＣｉｒｃｕｍｓｔａｎｔｉａｅ，３１（３）：４６８４７５利用ＰＣＲＤＧＧＥ溯源典型农村塘坝饮用水中的污染冯广达１，邓名荣１，郭俊１，王东东１，朱红惠１，，张曦１，３，梁浩亮２，朱昌雄３１．广东省微生物研究所，广东省菌种保藏与应用重点实验室，广东省微生物应用新技术公共实验室，广州５１００７０２．惠州市水产业科学技术研究所，惠州５１６００７３．中国农业科学院农业环境与可持续发展研究所，北京１０００８１收稿日期：２０１００６１７修回日期：２０１００８１０录用日期：２０１００８２６摘要：以华南地区典型农村塘坝饮用水为研究对象，采用基于大肠杆菌的两种特异性基因（βＤ葡萄糖苷酶编码基因ｕｉｄＡ和膜外周磷通道蛋白编码基因ｐｈｏＥ）的群体差异分析（ＰＣＲＤＧＧＥ），对饮用水中的污染情况进行了溯源研究．结果表明，采用富集培养的混合菌体ＤＮＡ作为模板扩增大肠杆菌特异性基因更加实用．ｕｉｄＡ和ｐｈｏＥ的引物均具有较强的特异性．对Ｇｅｎｅｂａｎｋ中已有的两种特异性基因序列的分析结果表明，ｐｈｏＥ的平均变异程度约为ｕｉｄＡ的２倍，基于ｐｈｏＥ的ＰＣＲＤＧＧＥ分析技术能够更好地反映样品之间的联系，适合在微生物溯源中应用．研究还表明，塘坝饮用水及其周围环境污染呈现面源特征，养殖废弃物是水体污染的主要来源．关键词：微生物溯源；大肠杆菌；ＰＣＲＤＧＧＥ；βＤ葡萄糖苷酶编码基因（ｕｉｄＡ）；膜外周磷通道蛋白编码基因（ｐｈｏＥ）文章编号：０２５３２４６８（２０１１）０３４６８０８中图分类号：Ｘ１７２文献标识码：ＡＭｉｃｒｏｂｉａｌｓｏｕｒｃｅｔｒａｃｋｉｎｇｏｆｐｏｌｌｕｔｉｏｎｉｎｔｙｐｉｃａｌｒｕｒａｌｐｏｎｄｄｒｉｎｋｉｎｇｗａｔｅｒｕｓｉｎｇＰＣＲＤＧＧＥＦＥＮＧＧｕａｎｇｄａ１，ＤＥＮＧＭｉｎｇｒｏｎｇ１，ＧＵＯＪｕｎ１，ＷＡＮＧＤｏｎｇｄｏｎｇ１，ＺＨＵＨｏｎｇｈｕｉ１，，ＺＨＡＮＧＸｉ１，３，ＬＩＡＮＧＨａｏｌｉａｎｇ２，ＺＨＵＣｈａｎｇｘｉｏｎｇ３１．ＧｕａｎｇｄｏｎｇＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＭｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ，ＧｕａｎｇｄｏｎｇＰｒｏｖｉｎｃｉａｌＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＭｉｃｒｏｂｉａｌＣｕｌｔｕｒｅＣｏｌｌｅｃｔｉｏｎａｎｄＡｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ，ＧｕａｎｇｄｏｎｇＯｐｅｎＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＡｐｐｌｉｅｄＭｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ，Ｇｕａｎｇｚｈｏｕ５１００７０２．ＨｕｉｚｈｏｕＦｉｓｈｅｒｙＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｈｕｉｚｈｏｕ５１６００７３．ＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＥｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｎｄＳｕｓｔａｉｎａｂｌｅＤｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｅｉｊｉｎｇ１０００８１Ｒｅｃｅｉｖｅｄ１７Ｊｕｎｅ２０１０；ｒｅｃｅｉｖｅｄｉｎｒｅｖｉｓｅｄｆｏｒｍ１０Ａｕｇｕｓｔ２０１０；ａｃｃｅｐｔｅｄ２６Ａｕｇｕｓｔ２０１０Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＴａｋｉｎｇｔｈｅｒｕｒａｌｐｏｎｄｄｒｉｎｋｉｎｇｗａｔｅｒｉｎｓｏｕｔｈＣｈｉｎａａｓｔｈｅｏｂｊｅｃｔ，ｍｉｃｒｏｂｉａｌｓｏｕｒｃｅｔｒａｃｋｉｎｇｏｆｗａｔｅｒｐｏｌｌｕｔｉｏｎｗａｓｄｏｎｅｕｓｉｎ