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人工湿地不同植物根际微生物群落多样性比较研究

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文档简介:

人工湿地不同植物根际微生物群落多样性比较研究的比值又称为根际效应(Rhizosphereeffect),用R/S值来表示。比较3种植物的R/S值:芦苇的根际效应最大,R/S值为7.63,香蒲次之,R/S值为6.25;黑麦草的根际效应最小,R/S值为4.39。3.2DGGE分析分析3.2.1PCR扩增样品总DNA进行PCR扩增,能够扩增出长度约200bp的DNA片段,见图1。图1PCR扩增结果扩增结果Fig.1DifferentsamplesamplifiedbyPCRX1香蒲根际,香蒲根际,Typhalatifoliarhizosphere;X2香蒲根区,香蒲根区,Typhalatifoliarootzone;L1芦苇根际,芦苇根际,Phragmitesaustralisrhizosphere;L2芦苇根区,芦苇根区,Phragmitesaustralisrootzone;H1黑麦草根际,黑麦草根际,Loliumperennerhizosphere;H2黑麦草根区,黑麦草根区,Loliumperennerootzone3.2.2DGGE指纹图谱DGGE指纹图谱如图2所示,样品可分离出16~23条数目不等、强度不同的条带。比较根际与根区条带数目:香蒲23/19、芦苇19/16、黑麦草22/22,差异较大,说明3种植物根际微生物群落结构存在较大差异。3.2.3多样性指数图像经QuantityOne数字化后,扣除背景强度(选择参数Rollingdisk,size5),检测条带的位置、数目和强度。表2所示,根际Shannon指数最高的是黑麦草,指数为2.86,最低的是香蒲,指数为2.82,表明黑麦草根际微生物丰富度最大,香蒲根际微生物丰富度最小;Simpson指数最高的是芦苇,指数为0.94,最低的是香蒲,指数为0.92,表明芦苇根际具有数目最多的常见物种,而在香蒲根区中常见物种数目最少;微生物Evenness指数最高的是芦苇,指数为0.96,最低的是香蒲,为0.90,表明芦苇根际和香蒲根际分别具有最大和最小的物种均匀性。根际多样性指数和均匀性指数均大于根区,芦苇根际和根区指数差异最明显,Shannon指数、Simpson指数和Evenness指数差异分别为2.83/2.52、0.94/0.91、0.96/0.91,表明芦苇根际能够更好的富集土壤微生物。3.2.4相似性分析

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